我国农产品检测机构基本形成了以农业行业系统内管理部门的质检机构、科研和教学的质检机构组成的体系格局，其他相关系统的质检机构相应补充的发展模式。根据其他系统在农产品质量安全管理部门的类别，主要有质检部门、卫生部门、环保部门、轻工部门和粮食部门等系统的质检机构。
四、我国农产品质量安全检测的机构管理和认可机制
农业部的部级质检机构均通过授权认可和国家计量认证，是依法设置的检测事业单位，出具的检验数据可作为法定仲裁依据。省及省以下设置的质检机构也均须通过授权认可和省级计量认证后，方具有向社会出具公正检验数据的资格。
五、我国农产品质量安全检测体系的运行情况(环球网校2015年中级经济师《中级农业》农产品质量安全检测体系知识点辅导)
法律依据：(1)综合性法律，如《农产品质量安全法》、《畜牧法》、《农业法》、《渔业法》;(2)产地环境法律，如《环境保护法》、《基本农田保护条例》等;(3)投入品法律，如《种子法》、《种畜禽管理条例》等;(4)地方规章;(5)认证和标准的法律，如《计量法》、《标准化法》。
开展的工作：普查工作，残留监控计划，农产品质量安全例行监测计划(农业部对饲料、兽药、畜牧兽医器械、天然橡胶、鱼粉等产品实施了强制性的生产许可证制度，从2010年开始实施了农药残留监控、水产品药物监控、饲料质量安全监控等一系列监控计划。截至2010年，例行检测种类扩大到10种，检测参数和范围涵盖29个，同时加快农产品质量体系建设，2010年共建设国家级、部级质检总局288个，省县地之间机构1900多个)。
经费来源：我国对农产品质量安全检测机构的投入，没有列入国家财政预算，没有固定和长期的经费来源。部分经费主要来源于基本建设的规划以及各类工程中。
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